根据一份发表在《自然》期刊上的研究，改变饮食习惯只需短短的一天便能显著改变肠道细菌的组成；或许这可以解释饮食和某些疾病之间的密切联系！

人体肠道中有超过10,000种不同的细菌对维持消化与免疫系统健康有着重要作用，这些微生物的数量之多，甚至超过我们自身的细胞 (比例约10：1)。科学家对肠道菌群的组成以及它们如何影响人体健康仍然所知有限，迄今为止所进行的研究仅表明这些微生物与某些肠道炎性疾病以及肥胖有关；高脂与高糖饮食也可能改变我们肠道内部生态系统。

为了进一步探讨饮食和肠道菌群间的联系，研究人员让10名受试者 (6男4女 ) 提交饮食日志并分析他们的粪便采样。前四天受试者吃的是自己日常所摄取的食物，接下来另外四天受试者则接受研究人员所分配的饮食 ─全蔬果或是全动物性食品；其中一位参与者本身吃素，也被要求改全吃蛋奶食物。之后受试者回到日常饮食，继续被观察六天。

研究人员发现，饮食改变一天，受试者粪便样本中的细菌含量就有显著不同。被分配到摄取大量动物性食品的人会增加对胆汁耐受性较好的细菌，而能分解碳水化合物的厚壁菌门 (Firmicutes) 细菌则相对减少；此外，肠道中常见的菌种也会改变它们的基因表现以帮助更好地消化蛋白质。

切换到以植物性食物为主的受试者则较无明显的变化，不过为了消化淀粉和纤维质，他们肠道内的基因表达更允许细菌发酵碳水化合物，这种饮食变化可以反映出草食性动物和肉食性动物之间的差异。

曾有研究透过老鼠实验观察到一日饮食的转变便能改变老鼠的肠道菌群，不过这个效应还没在人的身上见过。研究人员劳伦斯‧戴维 (Lawrence David) 认为，这次的成果让我们看到这些微生物即使在很短的时间内也能够灵活应变。

尽管肠道内部生态有如此敏捷的反应，它们也很难适应现代人过度地摄取加工与高脂食品。例如研究人员也观察到，以动物性饮食为主的人肠道中会增加一种叫做Bilophila wadsworthia的细菌，它们由于脂肪的存在而生长，研究显示会导致老鼠罹患结肠炎。这也许可以部分解释为何高脂肪饮食会导致炎症性肠道疾病发生。